境外开放课程——按学科专业列表
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Collaboration-based function prediction in protein-protein interaction networks[蛋白质相互作用网络中基于协作的函数预测]
  Hossein Rahmani() 我们考虑在蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络中预测单个蛋白质功能的问题。现有技术假设网络中拓扑上接近的蛋白质往往具有相似的功能。我们假设通过推广这一假设...
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Delay Compensation with Dynamical Synapses[动态突触延迟补偿]
  C. C. Alan Fung() 时间延迟在神经信息处理中普遍存在。为了实现实时跟踪，补偿神经系统中的传输和处理延迟至关重要。在本研究中，我们展示了具有短期抑制的动态突触可以增强连续吸...
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Exploring transcription regulation through cell-to-cell variability[通过细胞间变异探索转录调控]
  Nir Friedman() 细胞蛋白质水平的调节是一个复杂的过程，涉及许多调节机制。这些调节机制引入了一系列随机事件，导致细胞之间蛋白质水平的可变性。以前的研究表明，参与转录调节...
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Inference in hierarchical transcriptional network motifs[层次化转录网络基序的推断]
  Andrea Ocone() 我们提出了一种新的推理方法论来逆向工程分级网络图案（如前馈循环）中转录因子（TF）的动力学。我们提出的方法基于系统的连续时间表示，其中高级主TF表示为驱动...
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Inferring regulatory networks from expression data using tree-based methods[使用基于树的方法从表达数据推断调控网络]
  Van Anh Huynh-Thu() 计算系统生物学的一个紧迫的开放问题是使用高通量基因组数据，特别是微阵列基因表达数据来阐明遗传调控网络（GRNs）的拓扑。逆向工程评估和方法对话（DREAM）挑...
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Parameter estimation in biochemical reaction networks: An observer-based approach[生化反应网络中的参数估计：一种基于观察者的方法]
  Eric Bullinger() 生物系统建模的一个重要瓶颈是缺乏动力学参数的实验数据。测量技术的最新进展增加了从时间序列数据中推断这些参数的可行性（Anguelova等人，2007；Voit和Almeida...
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Parameter estimation using moment-closure methods[使用矩闭合方法的参数估计]
  Colin Gillespie() 这张海报将解决系统生物学新科学中的一个关键问题：使用系统状态的部分、离散和嘈杂的时间过程测量来推断复杂随机动力学生化网络模型下的速率参数。虽然精确随机...
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Predicting anti-cancer molecule activity using machine learning algorithms[使用机器学习算法预测抗癌分子活性]
  Jose Santos() 在这篇论文中，我们研究了-4000种独特化合物对60种细胞系（如白血病、前列腺、乳腺）的抗癌活性。小分子在生物学中起着重要作用，因为它们可以用作更复杂分子的...
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Probabilistic multi-class multi-kernel learning: On protein fold recognition and remote homology detection[概率多类多核学习：蛋白质折叠识别和远程同源性检测]
  Theodoros Damoulas() 蛋白质折叠识别和远程同源性检测的问题最近引起了人们的极大兴趣，因为它们代表了具有挑战性的多特征多类问题，而现代模式识别方法只能达到适度的性能水平。与许...
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Protein-protein network inference with regularized output and input kernel methods[具有正则化输出和输入核方法的蛋白质-蛋白质网络推理]
  Florence d'Alche-Buc() 在监督学习、无监督学习以及最近使用各种信息源（基因组、系统发育、蛋白质定位和功能）的半监督学习的背景下，预测两种蛋白质之间的物理相互作用已经得到了解决...
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Relation-Prediction in Multi-Relational Domains using Matrix-Factorization[多关系域关系预测的Matrix-Factorization]
  Volker Tresp; Yi Huang; Hans-Peter Kriegel; Christoph Lippert; Stefan-Hagen Weber; Matthias Schubert() 多关系域关系预测的Matrix-Factorization
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Statistical learning of biological networks: a brief overview[生物网络的统计学习：简要概述]
  Florence d'Alche-Buc() 识别生物网络，如信号通路、基因调控网络、蛋白质-蛋白质相互作用网络和代谢网络被认为是计算生物学中的一个关键挑战。使用机器学习框架，这个问题可以用不同的...
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Temporal Development and Collapse of an Arctic Plant-Pollinator Network[北极植物传粉网络的时间发展与崩溃]
  Carsten Wiuf() 获取翻译植物传粉网络的拓扑和连锁规则最近受到了广泛关注。难以研究的一个方面是网络的时间动态，因为它需要观察网络如何随时间变化。在这里，我们使用数学模型...
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Prediction of DNA-binding proteins from structural features[从结构特征预测DNA结合蛋白]
  Andrea Szaboova() 获取翻译中我们使用基于逻辑的机器学习来区分结合 DNA 的蛋白质和非结合蛋白质。我们将先前提出的粗粒度特征（如偶极矩）与自动构建的结构（空间）特征相结合。...
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PTMSearch: a Greedy Tree Traversal Algorithm for f inding Protein Post-Translational Modifications in Tandem Mass Spectra[PTMSearch:一种贪婪树遍历算法在串联质谱中发现蛋白质翻译后修饰]
  Milena Horvat , Martin Topole() 本文主要研究利用RFID技术在室内进行资源感知和经济高效的定位。除了佩戴有源RFID标签的人的追踪信息，我们还包括他们的近距离接触信息。我们使用在一次会议上收...
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