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生物信息学IIBioinformatics II |
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| 课程网址: | https://ocw.vu.edu.pk/CourseDetails.aspx?cat=Bioinformatics&cours... |
| 主讲教师: | Khizra Maqsood |
| 开课单位: | 巴基斯坦虚拟大学 |
| 开课时间: | 信息不详。欢迎您在右侧留言补充。 |
| 课程语种: | 英语 |
| 中文简介: |  生物信息学的应用，生物信息学数据库，序列格式，基因组信息学，原核基因组，真核基因组，表观染色体元素（EEs），基因组重复序列，转座因子（TEs），真核基因结构，比较基因组学，比较蛋白质组学，蛋白质组间比较，水平基因转移，基因顺序（序列），基因组注释，基因组测序，RNA结构，DNA转录，蛋白质翻译，动态规划I，动态规划II，动态规划算法，限制性图谱I限制性图谱II，部分文摘问题，实用限制映射算法，部分摘要算法，DNA序列中的调控基元，基元查找问题，搜索树，下一顶点算法，查找基元，基因组重排，序列相似性，编辑距离，得分比对，PAM矩阵，局部序列比对，渐进式多重比对，基因预测，剪接点预测，Predi外显子的功能，组装基因组的注释，基因组中的模式发现，模式发现算法，蛮力方法，Knuth Morris Pratt算法，DNA测序，蛋白质序列和鉴定，通过数据库搜索进行蛋白质鉴定，修饰的蛋白质鉴定问题，蛋白质结构预测，Chou Fasman算法，同源性建模，折叠识别/线程化，从头算建模入门，系统发育学，RNA结构，RNA二级结构，神经网络，机器学习，生物信息学在法医学上的优势，药物发现 |
| 课程简介: | Applications of Bioinformatics, bioinformatics databases, Sequence Formats, Genome Informatics, Prokaryotic Genome, Eukaryotic Genomes ,Epichromosomal elements (EEs), Genome repeats, Transposable Elements (TEs), Eukaryotic Gene Structure, Comparative Genomics, Comparative Proteomics, Between proteome comparison, Horizontal Gene Transfer, Gene Order (Synteny), Genome annotations, Genome Sequencing, Structure of RNA, DNA Transcription, Protein Translation, Dynamic Programming I, Dynamic Programming II, Algorithm for Dynamic Programming, Restriction Mapping I Restriction Mapping II, Partial Digest Problem, Practical Restriction Mapping Algorithm , Partial Digest Algorithm, Regulatory Motifs in DNA Sequences, Motif Finding Problem, Search Trees , Next Vertex Algorithm, Finding Motifs, Genome Rearrangements, Sequence Similarity, Edit Distance, Scoring Alignments, PAM matrix, Local Sequence Alignment, Progressive Multiple Alignment, Gene Prediction, Prediction of Splice Junctions, Prediction of Exons, Annotation of assembled Genome, Pattern Finding in a Genome, Pattern Finding Algorithms, Brute Force Approach, Knuth-Morris-Pratt Algorithm,DNA Sequencing, protein sequence and identification, protein identification via database search, Modified Protein Identification Problem, Protein Structure Prediction, Chou Fasman Algorithm, Homology modelling, Fold Recognition/Threading, Introduction to Ab-Initio Modelling, Phylogenetics, RNA Structure, RNA Secondary Structure, Neural Networks, Machine Learning, Advantages of Bioinformatics in forensic, Drug Discovery |
| 关 键 词: | 生物信息学; 基因; 法医学 |
| 课程来源: | 巴基斯坦虚拟大学公开课 |
| 数据采集: | 2021-04-20：nkq |
| 最后编审: | 2021-04-20：nkq |
| 阅读次数: | 94 |